Заявление в Министерство юстиции РФ об исключении из реестра некоммерческих организаций, выполняющих роль иностранного агента, подано на основании того, что в бюджете Центра ГРАНИ более года нет денежных средств из иностранных источников. Данного обстоятельства достаточно, чтобы организация после проверки была исключена из списка «иностранных агентов» в связи с изменениями в статье 32-й Федерального закона «О некоммерческих организациях», которые вступили в силу 20 марта 2015 года.
Для Центра крайне важно не находиться в этом реестре.
Помимо этого Центр ГРАНИ не занимается политической деятельностью и не считает принудительное включение в реестр законным. Решение о внесении в реестр организаций, выполняющих функции иностранного агента, в настоящее время обжалуется в суде.